在二十五年前，由于太阳发射的奥特耀斑导致产生一头巨兽，正在扰乱宇宙和平，这时，就在银河系出现了神秘的五彩光芒融合产生一位全新的奥特战士雷克斯奥特曼，雷克斯奥特曼就是这样诞生的，雷克斯奥特曼正在追逐远古巨龙怪兽龙畏斯过程中，雷克斯奥特曼与远古巨龙怪兽龙畏斯相撞，由于撞击的力度太大，再加上远古巨龙怪兽龙畏斯是头巨型怪兽，雷克斯奥特曼一下调入了正在燃烧着的太阳里面，火焰使其融化，化为了离子，但在这瞬间，雷克斯奥特曼用仅剩的能量将远古巨龙怪兽龙畏斯封印，但没有完全封印，使邪恶的气息外漏复活了一部分的怪兽，复活的怪兽开始在地球上作乱，先是出现在东京的宇宙怪兽百慕拉，在是出现在帕拉吉古城的磁力怪兽安东拉，为了抵抗怪兽作乱，地球防卫组织unver成立了怪兽特殊防卫队“tio”。
地球防卫组织怪兽特殊防卫队基地坐落于东京的深山中，就算有敌人入侵，也无法进入基地里面，基地外面周围被山体包围，入口是个山洞，并且由机关布置。
这天在特殊防卫队基地，地球防卫组织司令官在训话。
“从今天起，地球防卫组织怪兽特殊防卫队从今天起就成立了，介绍一下，这位是北野，是你们怪兽特使防卫队的队长，这位是上野是怪兽特殊防卫队的副队长，还有一位特殊的人物，这位是玛娜，是人工智能机器人，简要介绍一下怪兽特殊防卫队，怪兽特殊防卫队是由指挥部门，作战计划制定部门、情报部门、作战部门和特别行动部门等五个部门组成，指挥部门的指挥员由队长北野负责，我任总指挥，作战计划制定部门制定员有由副队长上野担任，情报部门情报员由人工智能机器人玛娜队员担任，听清楚了吗？”司令官问道。
“听清楚了。”全体队员回答道。
“我在介绍一下这五个部门，指挥部门主要负责，作战指挥方面的工作，作战计划制定部门主要负责，作战计划的制定，并交由指挥部门指挥员和总指挥审阅，情报部门主要负责收集敌人的数据情报做分析，作战部门专门负责外出作战，特别行动部门就是你们，相当于特别行动队，主要负责怪事的调查，还有跟作战部门一样同外来入侵者作战，并逮捕没有反抗能力的宇宙侵略者，之所以成立怪兽特殊防卫队的意义你们也知道，这几年来，怪兽又开始做乱了在过去的世纪，我听说维护宇宙和平的奥特战士一直来守护我们这颗星球，我们再不能依靠他们了，我们现在科技先进了，应该有能力和外来入侵的怪兽们作战，但并不是说我们不需要奥特战士，所以，不管在任何时间，我们都不能以奥特战士作为我们的敌人去攻击，虽然我没有见过奥特战士，好了，回到自己的岗位开始工作。”司令官命令道。
“是！”全体队员回答道。
就在这时，在龙森湖有位年老的爷爷正在钓鱼，突然，湖面上闪了一下蓝光，并开始冒泡，老爷爷看见了，感觉奇怪。
“咦，这是什么东西呀？”老爷爷奇怪地说。
话音刚落，从湖底就浮上来了一头怪兽，在龙森湖开始破坏，老爷爷一看是怪兽，吓的撒腿就跑，并拨通了怪兽特殊防卫队的电话，这时，怪兽特殊防卫队主控室的电话响了起来，天空队员拿起电话。
“喂，这里是怪兽特殊防卫队。“天空说。
这时，从电话那头传来焦急的声音。
“快，龙森湖出现怪兽。”老爷爷报告说。
“好的。我们马上就到。”天空回答道。
“报告队长，有居民报告说龙森湖有怪兽出现。”天空报告说。
“什么，怪兽，那位居民没看花眼吧，虽然组成了这个防卫队，也是为了安定民心，这世界上哪有什么怪兽。”青川说。
“青川队员，你没有见过就不要下结论，据说怪兽在上一个世纪可是出现过的。”香奈子说。
“青川队员，你忘了司令官的话了吗，好了，不管怎么样都应该去调查一下。”北野严肃地说。
北野队长话刚说完，这时，玛娜队员的投影被传输过来。
“北野队长，龙森湖确实出现怪兽，现在传送现场画面。”玛娜报告说。
“说一下敌人的数据。”北野命令道。
“是，这头怪兽在档案和xio档案里有同种族出现的怪兽，注册代号是宇宙怪兽百慕拉，身高50米，体重25000吨，曾经与初代奥特曼、银河奥特曼、维克特利奥特慢和艾克斯奥特曼都有交过手。“玛娜报告说。
这时，上野副队长的投影也传了过来。
“这是一头凶恶的怪兽，特别行动队和作战部门同时出动，攻击敌人。“北野说。
“tio，出动！”北野队长命令道。
“明白！”全体队员回答道。
于是，天空和香奈子驾驶“战鹰”号战斗机，青川和佐和子驾驶“猛虎”号战斗机随着作战部队驾驶战斗机出发了，赶赴了现场。
“北野队长，目标确认，请求攻击！”天空请求道。
“开始攻击！”北野命令道。
“明白！